曾用刊名：福建师大学报(自然科学版)
《福建师范大学学报（自然科学版）》是福建师范大学主办的面向国内外公开发行的综合性自然科学学术理论刊物，设有数学、计算机科学、物理学、化学、生命科学、地理科学、环境科学、运动学等栏目。
《福建师范大学学报（自然科学版）》创办于1956年，原刊名为《福建师范学院学报》，不定期出版；“文革”期间停刊， 1975年复刊，刊名为《福建师大学报（自然科学版）》，半年刊；1985年刊名变更为《福建师范大学学报（自然科学版）》，改半年刊为季刊，并使用卷号； 2007年起改为双月刊。
自复刊以来，丁汉波、林辰、林忠民、朱鹤健、吴松刚、李敏、林敏等知名专家学者先后担任过本刊的主编和副主编，现由王长平任编委会主任，杨玉盛、陈庆华、余望（常务）任编委会副主任，余望任主编。
经几代人的努力，本刊的社会影响日益扩大，刊物质量不断提升。近年发表的论文大部分为国家和省部级各类基金支持的成果，反映了学校的科研水平，收到良好的社会效益，是多家国内外权威检索刊物和数据库的来源期刊，在各级各类评比中也获得了良好的成绩。